Ну вообще, множественные теневые клоны реально опасная техника, ещё в каноне это было более чем видно по тому как она работает. Наруто, джинчурики, кто-то вроде Кисаме и прочих людей с чакрой как у Биджу застрахованы от части, но не от всех её проблем. Но мало кто пытался смоделировать как бы на них она отразилась без буквально бесконечной выносливости и запасов чакры.

Техника теневых клонов не похожа на сферическое "заклинание" в которого вложил 100 маны и получил клона. Техника делит чакру пополам между оригиналом и клоном (и немного тратит на самого клона). Т.е. 1 клон ополовинит ваш запас чакры. Три - оставят вас менее чем с четвертью вашего объёма чакры. Сотня - скорее всего выведет из строя/убьёт того джонина, что решил устроит такой зерг раш. Просто потому, что потратить практически все силы тела оставшись с сотой долей резерва явно не идет на пользу здоровью. Для Наруто с невероятным количеством чакры и её регенерацией это просто незаметно, но не для других.
Усталость. Клоны передаёт не только память и навыки, но и её. Хотите в один рабочий понедельник замахаться как за целую рабочую неделю? Создайте 4 клона на день. В конце дня, вы почувствуете на себе всю усталость рабочей недели и скорее всего вырубитесь на том месте, где клонов развеяли, а на следующий день проснетесь под вечер зверски уставшим.
Передача памяти. Мышление чертовски затратно для организма. Потому мы не очень любим думать постоянно, а напряженная работа мозгами ужасно иссушает тело. А теперь представьте, что такое обработать за один день недельный объем информации. Или месячный. Наруто очень повезло, что он не решил запустить на все свои ежедневные дела зерг раш клонов и использовал их больше в бою/для временной шалости.
Кстати, забавно, как её любят использовать в различной порнушке. А ведь это тот ещё сюр, всевозможные "групповух" с теневые клонами по их завершению и развеиванию клонов, заставят испытать пользователя такой экстаз, что сознание улетит куда-то к Рикудо, а из яиц выльется вообще все что там было. Или, сотня клонов с кучей женщин у всевозможных безбожно раздутых гаремах вроде "эрониндзи", да память и ощущения от клонов заставят оригинал ходить со стояком 24/7 просто потому какую именно информацию клоны будут ему переправлять. Ну, не плохое орудие психологического давления на противников, да.
- Это у тебя в кармане ключи, или ты так рад меня видеть?
- Клоны. Слишком много клонов и женщин.
Итог: технику придумывали совсем для других целей, серьёзно отличных от тех, какими страдают в фанфиках. Это техника для Разведки/козырь для кого-то вроде Джинчурики, но не для рядового шиноби. Наруто успешно избегал или нивелировал большую часть этих эффектов, но емнип, когда Какаши предложил ему этот метод, то даже он в начале вырубился от перегрузок. Что показательно. А так она даже близко не настолько абъюзна если вы не перерождение полубога из семьи Каге и Джинчурики с биджу в пузе. Без бесконечно выносливости и грамотного планирования к ней лезть реально не стоит.