Всегда во всех войнах есть деление на военных и гражданских. Человек становится военным, чтобы сражаться за какие-то идеалы (причём в случае Империи эти идеалы ещё и довольно-таки тухлые и фашистские, прямо скажем). И военный знает, что за эти идеалы он может погибнуть. А гражданский хочет просто жить мирной жизнью. Поэтому, когда убивают гражданских - это куда более тяжкое преступление. Гражданские не стреляют в ответ, не могут сопротивляться. По факту, это мирные жители Империи, которых Таркин уничтожил. Своих же мирных граждан. Так понятно?


Все 2 миллиарда были сплошные повстанцы? Даже грудные дети? Ну ок.
Надо думать, если мысль прозвучала, то проверять её не надо - надо сразу делать экстерминатус. Есть там повстанцы, нет - заподозрили - уничтожили. Нормально.