ВероникаД , я думаю, в тот самый момент Снейп ничего не понял, так как был по-прежнему слишком ранен и выбит из колеи мыслью, что директор тайком приказал Муди обыскать его кабинет. Может быть, уже после той сцены и после разговора с Дамблдором у него могли появиться первые подозрения... хотя Снейп позже обвинял Гарри в том, что это он ворует ингредиенты для Оборотного зелья, и казался искренним. Так что скорее всего, он опять был слишком ослеплен эмоциями, чтоб трезво мыслить.