Lothraxi, окей. Допустим, Снейп реально не знал ни о чем, а о попытке поимки ГП узнал через Метку.
Первое. Не знал Снейп, но абсолютно точно знали Кэрроу? Знали тупые шестерки, пугала для школоты, но не знал один из ближайших к ВдМ ПС? Маловероятно. Точнее, вероятно только в одном случае - если ВдМ подозревал Снейпа в предательстве и не доверял ему. Не стыкуется, т.к. Волдеморт о предательстве Снейпа не знал до дуэли с Гарри.
Второе. Как Снейп по Метке мог узнать, что Алекто поймала именно Гарри? Метка - это не рация, а рубильник: загорелась зеленая лампочка - все к шефу, загорелась красная - шефа зовет кто-то из своих. При этом, судя по канону, ПС не могут вызывать друг друга, только ВдМ; непонятно даже, чувствуют ли они сигнал от другого. Соответственно, понять про Гарри Снейп мог в двух случаях:
1) Если заранее было оговорено, что Алекто жмякнет Метку только в том случае, если поймает Гарри;
2) Алекто жмякнула Метку, ВдМ на это отреагировал, реакцию почувствовали все ПС, в том числе Снейп и Амикус, сразу ломанувшийся проверять, чекак там у сестрички.
Первый вариант возможен только в случае, если ПС чувствуют чужие вызовы ВдМ, что не подтверждено каноном, второй более вероятен с т.з. функционала Метки, но возвращает нас к первому пункту (знали Кэрроу, не знал Снейп).

Энивей, все сводится к тому, что Снейп с большой долей вероятности знал о проникновении Гарри в Хогвартс, но почему-то не допустил мысли, что Гарри будут отбивать. И не озаботился убрать малолеток.