Насчет ЗВ.
Есть, конечно, всякие люди, и всякие фанаты, но так-то всех Империя или Альянс привлекают некими содержащимися там идеалами. Разумеется, эти идеалы крайне различны. Более того, они конфликтуют.
Что там, что там есть неадекваты и полные отморозки, увы, чьи руки по локоть в крови.
Что там, что там есть благородные люди и не только, которыми движут исключительно высокие побуждения и которые не принимают участия во всем этом беспределе.
Так что я могу понять тех, кто разделяет какие-либо идеалы и причисляет себя к той или иной стороне.
Это - нормально.

Ненормально как раз описанное в посте оправдание явных мерзостей и явных отморозков. Вот это уже заставляет задуматься, что тут что-то явно не так.

Насчет кодгиасс...
Тут сложно на самом деле. Возможно, дело в том, что ГГ в данном случае куда как более харизматичен, умен, и в целом интересен для, скажем так, среднестатистического человека.
Логично, что людям приятнее ассоциировать себя с коварным, умным, красивым и харизматичным героем, да еще и с явно лидерскими качествами и выдающимися способностями к тактике и стратегии.
Чем - с, прямо скажем, слегка наивным, а порой и не слегка, юным деревенским парнем, у которого личной мотивации куда меньше - поначалу.