Если это был ПЛАН (вряд ли, но допустим), то условная Макгонагалл могла под заклятьем хамелеона или в мантии-невидимке стоять рядом и страховать. План - он, ну, контролируется. Или даже не Макгонагалл, а лично Дамблдор. Он невидимым становится умеет точно, думаю, получше, чем просто хамелеоновыми чарами. А я лично не думаю, что Гермиона - часть плана изначально.

Во-первых, я не думаю, что Люциус САМ решил распорядиться артефактом именно так. Могли быть инструкции от Волдеморта и/или, что ещё интереснее, личное общение Люциуса с Дневником. И план, кстати, почти удался:
а) Дамблдора выгнали из замка нафиг с хорошим шансом, что оно будет навсегда
б) Волдеморт едва не возродился
То есть, Волдеморт и Малфой оба получили бы, что хотели. Правда, "не тот" Волдеморт бы возродился, а Том-из-дневника, и неизвестно, какие у него взаимоотношения с оригинальным Волдемортом, но, полагаю, быть живым ему больше нравится, чем в дневнике сидеть, хех.

Берёшь книгу "зелья и заклинания для вашего питомца-крысы", варишь, накладываешь - и всё. В Мунго, кстати, отправляются в 99% случаев не с немагическими болезнями, а с болезнями, вызванными магией. С немагическими у магов проблем нет - вестимо, справляются самостоятельно, выпей зелье A, запей зельем B, и готово. С питомцами то же самое.

С чего вы это взяли? Вообще как понять, что это анимаг? В каноне вообще неочевидно. Рита, вон, мимо носа Дамблдора проскальзывала, а Сириус - в Азкабане так ныкался и бежал оттуда. Всё это как бы намекает, что анимагия - ну не то чтобы имба, но штука, с которой маги работают плохо. Анимагов, вероятно, не умеют засекать, а накладывать обратно-трансфигурирующие чары на каждое первое домашее животное - это упоротым надо быть.