Научный метод ещё как применим выдуманными персонажами к выдуманному миру. К выдуманному миру неприменима научная картина мира нашего. Потому что в нашем нельзя махнуть куском дерева с кусочком животного внутри, сказать пару простых слов, и получить что-либо, помимо несильного ветра.
Я вполне имею представление, как работают электрончики. Я знаю общие принципы каждого процесса, который происходит во время отсылки. НЁХ не случается.
Вернёмся к твоим теориям и магическому миру.
Учёный, начавший изучать магию, но пытающийся ее втиснуть в известную физику, будет выглядеть таким же идиотом, как и учёный, упорно тянущий ньютоновская механику на микро или квантовый уровень. Даже на макроуровне он будет идиотом.
Нормальный учёный применит научный метод к самой магии. Теории взаимодействия магии и физики, где прекращает действие одно, а начинает работать другое, эксперименты, отброшенные теории, дополненные и вновь отброшенные.
Нормальный учёный не будет загонять себя в прокрустово ложе какой-то имеющейся теории и похуй на всё остальное. Это будет уже верующий, только в качестве молитв использующий цитаты учебника физики.