"На подумать" скорее ужаснуло. Многие вообще тогда перестанут комментировать, да мне самой не хотелось бы, чтобы мои комментарии дублировались. Я пишу их своим читателям или авторам, которых читаю. И чужие комментарии в ленте тем более видеть не хочу, и я так давно прошу скрыт по фикам в общей ленте комментариев. Эти 70 с плюсом комментариев в день к фикам, которые я не читаю иногда утомляют.

По теме веток: Считать комментарии надо все, независимо от первичности.

Нужна возможность открыть все комментарии во всех ветках, т.к. открывать все ветки утомительно, а иногда хочется прочесть всё обсуждение и производные.

Вообще я не поддерживаю в целом идею веток-комментариев. Я за внедрение кнопок: "комментарии ко всему фику" и "комментарии к каждой главе".
Устроить их так: при наборе/отправке отзыва сделать две кнопки соответственно, чтобы читатель сам решал, куда он отправляет отзыв.
А на странице фика выводить все отзывы, но в уголке где-нибудь на полосе с ником комментатора указывать номер главы, к которой этот отзыв написан, если он не ко всему фику, а к главе. На него щёлкаешь: откроется страница со всеми комментариями к главе.