На самом деле идея очень хорошая. Потому что частенько в комментариях к фикам разворачивается флудильня, которая раздражает, но от которой не отпишешься, потому это будет подразумевать отписку от всех комментариев к фику вообще. А вот если бы этот флуд лился в ветку какого-то одного комментария — можно было бы отписался только от этой ветки.

Предложения:

1. Автор может «прилепить» комментарий (свой) сверху (по аналогии с блогами), с текстом «крики "проду" писать сюда», например.

2. Не делать верхние комментарии блогопостами, это ещё больше запутает, да и неправильно это. Блоги — отдельно, фики — отдельно. Пускай так и остается.

3. Дать автору возможность отметить несколько комментариев верхнего уровня и перенести их все скопом на второй уровень какой-либо ветки. Это на случай, если продолжат флудить «по старинке» на верхнем уровне.

4. Сделать возможность открыть ветку какого-нибудь комментария на отдельной странице (по аналогии с блогами), чтобы сразу была видна вся ветка комментариев второго уровня.

5. Комментарии верхнего уровня, которые пишут на странице главы фика, должны автоматически получать привязку к этой главе.

6. При ответе (кнопка "Ответить") на комментарий верхнего уровня (или на любой комментарий второго уровня) — ответ автоматически попадает в эту ветку, а не становится комментарием верхнего уровня.