Негативной окраски не несут в феминитивах суффикс -ца, и -эсса
Про -ша уже сказал Feature in the Dust, но теперь он используется в ином значении, и звучит как менее уважительно, чем если без феминитива. Доктор-докторша.
-ка в профессиях и ролях выражает иронию, ехидство, неуважение, пренебрежение. Если с именами - то либо то же, что и в профессиях, либо показывает что вы с этим человеком близки и лично вам его так можно называть.