Мне удобны только комменты к главам, но, думаю, тут определенную роль играет привычка. Хотя когда читаешь главу уже законченного фика, и хочешь почитать к ней комменты, то если всё вместе, это мешается и нужное не найти никогда. А я люблю читать чужие комменты под чужими фиками))