fb2 - это формат, в котором очень много возможностей и условностей. Если делать конвертер, учитывающий все возможности формата, то я быстрее состарюсь. А если учесть все варианты, как этот формат кто-то мог использовать при составлении книги, то и всей жизни не хватит.
Тем более, что ситуация, когда автор имеет fb2 файл своего произведения, - скорее исключение, чем правило. Если же вы подразумеваете тот fb2, который умеет генерировать самиздат, то разве в нем есть какие-то заголовки, если их в самих текстах-то нет?
Я мог бы сделать скрипт импорта произведения с СИ, благо ФвФ уже умеет его парсить, но именно из тех соображений, что там все плохо с разметкой, я этого делать не планирую.