Ну, так на SEELE работают люди самых разных профессий. Это ведь не фирма и не министерство, а тайная организация. Гэндо был завербован в неё. Ведь он мог дать SEELE информацию "из первых рук" о том, что "нарыли" Фуюцуки и Кацураги. Похоже, что поначалу именно в этом и заключалась его главная ценность для SEELE. А уже в послеударном мире он проявил себя как незаурядный администратор. И прежде всего как раз в сфере организации научной деятельности. Ведь и GEHIRN, и NERV — это изначально именно исследовательские организации.