Если посмотреть цитатник по характеру и личности Маргариты с выведенными качествами, то там одна сплошная Гермиона.)
Мне особенно понравилось вот это про Маргариту:
"...У нее была страсть ко всем людям, которые делают что‑либо первоклассно..."
Можно, как ключом, открывать мотив Гермионы сохранить первоклассно работающие мозги Шерлока и уберечь его самого еще в первой части. Гермиону, как магнитом, притягивает к очень умным людям.
По качествам характера, я вижу одно принципиальное различие: Гермиона в отличие от Маргариты деятельна на протяжении 10 лет. И это меняет картину развития персонажа.

Вот так из спортивного интереса идешь притягивать за уши аллюзию ("натягивать сову на глобус"), а она прыгает прямо в глаза.) Я не помнила толком текста Булгакова и деталей, только свои ощущения от психологических образов персонажей и их истории любви. Не помнила, потому что их история мне не близка, так как в ней видится одно сплошное бегство от реальности и самих себя в любовь как в спасение.
Но равнодушие к истории любви Маргариты и Мастера не отменяет того, как прекрасен образ обнаженной Маргариты, вылетающей в окно на метле.. чистая женская сила. И как стоит он того, чтобы прошило чувством даже до зубовного скрежета чопорно-сдержанного Майкрофта.

Судя по прочитанным мною текстам Авады по "Шерлоку ВВС", наш милый автор не склонен уводить персонажей в любовную аддикцию как в спасение от мира. Поэтому могу предположить, что если есть аллюзия на роман Булгакова, то она будет переиграна, точнее она уже переигрывается путем ослабления Гермионы (в противовес: сильная от отчаянья после 10 лет непонятно чего Маргарита - слабый, ведомый Мастер, и путь им только в иной мир).
Сильная Гермиона уже сделала слишком много. Гарри она вытаскивала из наркопритонов. Майкрофта она вместе с Шерлоком поймала, закрыла собой его просчет в стабильности участия Министерства Магии в операции с Мориарти. Одна отработала за все Министерство и переиграла его, имея на тот момент нужные наработанные социальные и профессиональные контакты (какая слабая личность может таким похвастаться?) и сжигающее все препятствия желание вывести из под удара Холмсов, сохранив обоим шедевральные мозги. И она почти буквально поймала сердце Майкрофта, как неуклюже столкнутую со стола статуэтку, не дала ему разбиться. И просто вернула обратно. И делала она это, мысленно не говоря "во имя дружбы" или еще чего-то более громкого, она бессловесно напрямую резонировала и просто не могла допустить, чтобы Шерлок погиб, и это искорежило Майкрофта и загнало в яму вины. Очень это похоже на милосердие, которое проявляет Маргарита к Фриде (бесконечно виноватой за содеянной с ребенком) на балу.
"...Я хочу, чтобы Фриде перестали подавать тот платок, которым она удушила своего ребенка..."