Odgorian, ну, это не совсем постапокалипсис, хе-хе.
"единственный вопрос — а как были убиты умнейшие?" - просто. Демократией. Гнев толпы, направленный через ИИ. И ещё проще. Руками. Особенно забавно, что "умнейшие" не имели модификаций на чистую физическую мощь, равно как и, в большинстве своём, не умели обращаться с оружием, ибо нафиг? Возможно, не обошлось и без предательства и хитрых планов одних "умнейших" против других - факт в том, что погибла достаточная часть "ядра" умственного потенциала, что он не смог восстановиться и плавненько угас. Остатки "умных" пытались направить силы Управителей, чтобы справиться с похолоданием, а не о размножении (в т.ч. в смысле учитель-ученик) своём думали. Отчаянно пытались, до самой смерти, кстати, результат таки был, но в перспективе оттянуть процесс на столетие-другое... бесполезняк-с. В общем, первоначальная гибель "умнейших -" это последняя "разборка" в реальности, ну а окончательная гибель очень сильно затянулась.

"директива, не позволяющая прикончить идиотов" - вообще говоря, да. Но тут речь скорее о культуре. После исчезновения государств агрессия, в основном, уходила в виртуал, было чёткое разделение реале и вирта, своего рода преграда... ну не знаю, табу, как у нас инцест или каннибализм, выплёскивать насилием и давлением эмоции в реальности. Вот в виртуале - что угодно. Но когда страха стало слишком много и он перерос в гнев... Это было единственное массовое нарушение табу. И к нему не был готов никто.

"гении не стали бы настолько сильно ограничивать свои творения" - изи, потому что - а зачем слишком много свободы давать по умолчанию? Всегда можно, имея ключ, давать временные разрешения и полномочия. Это надёжно. Никто ж не знал, что создатели и управляющие системы умрут, а ключ будет утерян (кстати, утерян предумышленно, последние из "администраторов" очень не хотели, чтобы он попал в руки оставшихся виртуальцев).

Ну и, да, не совсем же дебилами была основная масса. Низкий интеллект - это не дебилизм. Это просто низкий интеллект. Десантник может быть глупым, но это не помешает ему быть хитрым, быстрым и мастерски владеть всеми навыками десанта. А то и занимать командную должность. И даже быть на своём месте. Не без квадратно-гнездовых методов, но всё же. Они такие же люди. С низким интеллектом, это верно, но вполне себе приспособленные пользоваться виртуалом и, например, теми модификациями, которые внесли себе в организм, от генетической перестройки до имплантов всевозможных типов.