А убивать-то зачем? Если в упор влепить тем же ступефаем, то как бы ты крут не был, защититься не успеешь, хотя бы потому что не заметишь. А потом можно и инкарцео накинуть вторым заклом. Так что не вижу моральных дилем)
Скорее понятно, что Гермиона растерялась из-за Гарри. И приоритеты расставил очень по-человечески не логично. Но спустя время есть вариант, что могла бы додуматься. А может и нет. Маги так привыкли швыряться заклами издалека, что про ближний бой Гермиона может и не догадаться.