Геркулесовна, Дамблдор вообще никому ничего не запрещает. Свобода выбора, так сказать.
Почему Снейп продолжал поддерживать приятельские отношения с Малфоем здорово разобрано в "Быть Северусом Снейпом". Как шпиону Снейпу это было выгодно.
Тут нужно еще добавить, что Малфой совсем не жаждал снова присоединяться к Лорду, с него явно этих приключений было достаточно; поэтому Снейп был важной точкой связи Малфоя с Дамблдором, если Малфой когда-нибудь решился бы пойти против Лорда.