Когда происходит кроссовер двух миров, о каких вообще канонах может идти речь? Нет, понятно какие-то вещи безусловно так и остаются фундаментальными, но грани, на которых происходит пересечение двух миров, можно лепить как удобно автору. В данном случае мы видим, что магия в Вселенной МЭ таки работает, а значит и существует, следовательно Жнецы вполне могли действительно как-то воздействовать и на души живых существ. Ведь если с душами может работать один из разделов магии - некромантия, это вовсе не означает, что нет никаких других путей воздействия на души. Магия - это лишь одна из частей вселенной. Кроме того допуская существование двух разных миров/вселенных, очевидно, можно сделать вывод, что таких пространств больше чем два, а значит где-то в другой Галактики могут править бал ситхи, псионики и так далее. А то, что магия вполне работает во вселенной якобы немагической, приводит нас к выводу, что в этой же вселенной в той же степени вполне работает и Сила, и псионические силы (классика псионов, например из Xcom), и всякие Варпы (вархамер). А значит могут быть и прочие "науки", позволяющие воздействовать на души, на один из таких способов случайно и натолкнулись Жнецы, используя его для своего создания, и даже не подозревая, что именно они делают.