Не, если бы он мыться не любил, от него бы плохо пахло - и Гарри бы это отметил (ведь в книге мы Снейпа видим глазами Гарри, который отмечает все неприятное в несимпатичном ему человеке).
Я думаю, тут действительно волосы от природы жирные, и плюс еще он много времени над кипящими котлами проводит.