"Получить организм из десятка (ну, или чуть большего количества) клеток можно через клонирование" - нам нужен не "организм", а "тот же организм". И, нет, клонирование работает не через десяток рандомных клеток.

"или смоделировав весь процесс - если магия позволяет такие возможности" - это уже почти концептуальщина.

"Тело получится не самым точным - будет не исходный человек, а его брат-близнец, причём без штук вроде старых шрамов или других особенностей в процессе развития" - ну-ну. То есть, это всё, конечно, хорошо, но конкретный механизм так и не был предложен. Неконструтивно, товарищ, неконструктивно.

И насчёт баланса. Всё перечисленное в посте, за исключением биомагии, требует примерно одного порядка информационной сложности. Биомагия делается на чуть более высоком уровне, поэтому необратимая и всегда кривая, ведущая к уродству, только волей роялей и сюжетной брони не убивающая персонажа. Другие маги в попытках усовершенствоваться обычно превращаются в страшных, лишённых разума тварей, ага, но это же протагонист, ему повезло! А уровень инфосложности для сознательного оборота, да ещё и обратимого - он на много порядков выше. Соответственно, баланс против. Уничтожение материалов, к слову, инфосложности несёт минимум, создание - по сути, по игровой механике, то же копипаст, аналогично. А вот моделирование развития живого существа - это далеко за пределами.