Maiolika
Это вопрос технической реализации. Записывать поименно каждый комментарий и при удалении пересчитывать еще и счетчики непрочитанного - это много кода, который надо написать. А решение не идеальное, останутся недовольные тем, что они вот видели мол непрочитанных было много, стало мало и т.д. Тоже будут волноваться и недоумевать. Есть еще один вариант, оставлять надпись «комментарий был удалён», на многих сайтах так и сделано, но это тоже многим не нравится: «зачем мне знать, что тут был комментарий, нет уже и ладно, а я дергаюсь». Идеального решения я не знаю и на любое новое решение нужно время на реализацию.