Вообще-то, если по серьёзу, то то никакие болезнетворные организмы иного мира на "пришельца" действовать не должны - они такого не кушают. Это если мир и вправду иной. Только тогда и сам попаданец хз что кушать будет - белки-то другие...
А если мир биологически такой же, то да, кое-что может словить. За примерами и в другой мир ходить не надо. Достаточно жёлтой лихорадки, от которой пришельцы из Европы дохли шо мухи осенью (практически со стопроцентной гарантией), а местные вообще не замечали. Потому как для взрослых это жутко вирулентная дрянь почти гарантированно летальна, а дети её переносят как насморк, приобретая иммунитет на всю жизнь.

Впрочем, тут возможны варианты. Например, если попаданец, скажем, мой ровесник (или младше, но не слишком), так у него есть прививка от оспы. От которой в Средние века мёрли примерно как нынче от короновируса, а то и покруче. А ещё нынче прививают от туберкулёза, коклюша, дифтерита и чего-то-там-ещё, не помню (АКДС которая). Тоже неплохой такой бонус, про который, кстати, авторы обычно забывают. А как обыграть можно!