Животные в багаже всегда перевозятся как негабарит, т.е. за отдельную плату. Эта плата не входит в билет. И если была предоплата (что кстати вряд ли, т.к. обычно ее платят на месте, после взвешивания), а животное не улетело, то эту предоплату всегда можно вернуть по письменному заявлению авиаперевозчику.