Как учил нас великий волшебник Кырла Мырла, базис определяет надстройку, а не наоборот.
Религия - это повод, обоснуй задним числом.
По факту же нагибание любой социальной группы происходит ровно по двум причинам:
1) Мы хотим их нагнуть (у них есть то, что можно с пользой для нас отнять)
2) Мы можем их нагнуть (их политическое/экономическое влияние невелико)
Собственно, эти две причины можно свести к одной: потенциальные затраты на нагибание меньше, чем потенциальная выгода от нагибания.
По этому критерию нагибание волшебниц абсолютно невозможно и бессмысленно.
Но опять же, этот критерий действует в реальном мире, а в мире Роулинг действует только авторский произвол. Так что СЕЙЧАС патриархата нет, это в каноне показано чётко. А пару сот лет назад можно рисовать что угодно - хоть абсолютно раскрепощённых, хоть совершенно закрепощённых, хоть вообще доминирующих ведьм - ничто из этого канону не противоречит. Противоречит здравому смыслу, но здравый смысл в этом мире и не ночевал.