При всей моей любви к животным, в данном случае считаю, что клетка вполне себе выход. В конце концов довольно часто на период карантина животных вот так изолируют, помнится в блогах не один пост был и что-то не помню такую массовую атаку, а там и котик после улицы, и котенок были.
Да, стресс, но это куда лучше, чем если кошки реально сцепятся, а удержать очень агрессивное животное надо еще суметь, не покалечив ни его и не дав покалечить себя.
У нас соседская кошка гостью в свое время страшно подрала, пыталась добраться до мелкой собачки на руках у хозяйки, просто полезла по ногам, как по дереву. Ну, там гостья зря зашла на участок с собакой в то время, когда у кошки были мелкие котята, но то дачный участок был, не дом. Никто не ожидал, что она так взбеленится. Так что кошки ого-го какие опасные бывают.
Тем более в положении ТС, где и без того куча нервов.

o_Ossus Totalus, сил вам, крепких нервов и терпения.
Видимо, реально только дома ее и оставлять, проведывая раз в 2-3 дня, раз ей настолько плохо оказалось и что стресс проявляется агрессией.
Ваше здоровье сейчас важнее. Вам не только о себе надо думать.