Совет джонинов каноничная организация, они в Конохе утверждают или не утверждают хокаге (а выбирает его даймё, или, видимо, предыдущий хокаге, уходя в отставку). Это совет кланов полностью фаноннейший фанон (ну или по некоторым оговоркам всё же существовал в прошлом, состоя из членов двух сами знаете каких кланов, да Хаширама его распустил, советом джонинов заменив).