Черная Птица
Обычно - отдельным. Но иногда не очень хочется разбрасываться. Это на Фанфиксе есть возможность объединять истории в серии, но на многих ресурсах такой опции нет. И вот чтобы не делать кучу приписок "Вот этот мини - вбоквелл к вот этому макси (пройдете по ссылке такой-то)", добавляют "Экстры".

_Chiffa_
А почему вы решили, что экстра - это обязательно "отношеньки"? О.О
Это может быть эпизод из детства, какие-нибудь приключения, которые не вписывались в основной таймлайн, соперничество с кем-то, кого не хотелось полноценно прописывать в основной истории...
Это может быть зарисовка про второстепенного персонажа: в основной уделять ему слишком много времени неуместно, чтобы не перетягивать одеяло с главных героев, а в экстре поведать о нем нечто интересное - в самый раз.
Это вообще может быть сюжет из прошлого: история артефакта, вокруг которого вертелся сюдет, байки мира, где все пооисходит...

Короче, экстра - это как раз не эпилог. Это довесок, который в основную историю "не влезает по формату": про другое время, других персонажей, другие события. _Связанные_ с основным сюжетом - но не так, чтобы напрямую.

Ну а уж кто как это пишет - на совести каждого автора.