Нет. Договоры действуют только тогда, когда у обеих сторон есть силы принудить друг друга к их исполнению. Это первое. Второе. Договоры не бывают вечными. Ваши условные секты Меча и Феникса могут договориться друг с другом, что на троне сидит представитель этой конкретной семьи. Но конъюнктура может измениться, усилится, скажем, секта Дырявого Чайника - и всё, придётся пересматривать договор с учётом изменившихся обстоятельств. И при этом раскладе ваш император уже не субъект политики, а объект.
А у вас не две секты, у вас их больше. И власти хотят все.

Если под контролем, то уже не партнёр.

У вас одна проблема: у государства нет рычагов давления на этот самый спецназ. Вот вообще. Договор рычагом не является.

Если сект много, они рано или поздно раздербанят страну на кусочки. И похрен на императора, он ничего им не может сделать, у него даже армии, с которой надо считаться, нет. Секты будут воевать друг с другом в попытках поставить своего управляющего имением.

Политическую интригу о консолидации власти в одних руках, приведение сект в полное подчинение императору вы не вытянете. И да, при таком сюжете ваша наложница - это там, второстепенный персонаж. Основными становятся император, главные в сектах и прочие, кто может что-то решать.

Либо надо серьёзно пересматривать концепцию. Верховная власть на то и верховная, что выше никого нет и что сила за ней.

И да. Зачем тут вообще попаданка?