Aneta
и снова согласна с вами
и добавлю, что встречаться она стала с ним только после смерти его родителей.
когда Джеймс на фоне этого сбавил обороты (то же Роулинг и ее допы)

НО! это вовсе не мешало ей:
1. видя интерес к себе одного из интересных мальчиков потока, испытывать вполне логичную женскую гордость
2. иметь внутреннее приятие этого и даже симпатию к нему
3. испытывая эту симпатию и видя, что он может быть нормальным (ведь в Гриффиндорской гостиной он наверняка был нормальным), разочаровываться в нем раз за разом, видя его отношение к тому же Снейпу.

при таком раскладе и ее долгая пикировка с ним, и ее презрение во взгляде в тот же момент - все это вполне объяснимо.

могли ли быть у Снейпа шансы на ответное чувство, несмотря на эту симпатию Лили к Джеймсу? Думаю, могли. Потому что симпатия в 15-16 лет - это такое размытое понятие.
в этом возрасте как раз-то никто и не ждет вечной любви.
та же Гермиона - сперва Крам, а только затем Рон. И нельзя сказать, что Крам ей не нравился - целоваться она явно с ним училась.

Так что и тут, даже несмотря на эту симпатию, при другом раскладе в итоге Лили могла и полюбить Снейпа. По крайней мере, отвращения как таковой он у нее не вызывал. Ее отвратил от него его поступок.