Потому что даже Марти-Сью может быть скучно жить в столь предсказуемом мире под Годмодом. И вообще мир гораздо сложнее, чем Вам кажется. Неизвестно, что и в какую сторону изменится, если Риддла как такового в мире не будет - он ведь один из ключевых магов 20-го века в Британии. Вот убери Поттера в детстве и вполне возможно, что ММ бы уже вообще прекратил существование в 21 веке, потому что это ему было "больше всех надо" и он сумел инициировать, организовать и уговорить других магов, в том числе древнейших и сильнейших (к которым свалился буквально на головы благодаря своей Поттеровской удаче) устроить "сепарацию ММ" от мира обычного. Но Гарри такой как он есть появился в том числе и благодаря Волдеморту. Ну и еще думаю с возрастом Поттер научился ценить жизнь. Жизнь каждого уникального мага - ценность для ММ, капля силы в общем источнике. Плюс здесь Томас еще подросток - себе на уме, но адекватный, хоть и не особо добрый, редкостно талантливый и прочее. Он пока не Волдеморт, более того, если Гарри приложит усилия, то возможно что никогда и не станет, а у ММ будет наконец-то талантливый министр. А убить что? Убить никогда не поздно. Подозреваю нынешний Поттер пусть и в молодом теле, но со знаниями, опытом и навыками его бурной жизни, даже взрослого Волди в полной силе завалит без избыточных усилий. Томас все же скорее гениальный ученый, чем боевик (пусть много знает, умеет и исключительно сильный маг), а Гарри как раз больше боевик, чем ученый.

Разница очень хорошо объяснена в одном из фиков (а "в Борьбе обретешь ты...") есть диалог между Лонгботтомом и Грейнджер, в котором Невилл сказал, что его бабушка в бою сильнее МакГонагалл, а Гермиона возмутилась, что мол это дискриминация и вообще декан очень сильная магичка. Тогда он очень просто ей объяснил, что тут дело не только в силе (хотя и по силе чистокровная Августа сильнее Минервы), но и в специализации. Они же будут сражаться, а не предметы на скорость трансфигурировать. Леди Лонгботтом - боевик по родовым талантам. охотилась в юности на оборотней и всю жизнь тренировалась, а МакГонагалл просто училась в рамках общей программы и увлеклась дуэлингом.