А почему он, собственно говоря, должен всё время о них скучать?

никто не говорит, что все время. дело в другом: он вобще о них не вспоминает. вот это и кажется неправильным.

"и так как ГГ их мысли в данном вопросе разделяет,"
Где об этом сказано?
Как-никак ГГ сам по факту маглорождённый.
И в последней главе явно намекалось на неприязнь ГГ к магическому миру.

не сказано, согласна. но так как характер ГГ еще только начинает раскрываться, приходится делать предположения. поэтому, исходим из его круга общения, который он подобрал себе по сходству интересов.
ГГ по своей натуре отделяет себя от всего остального мира. он не думает о себе как об одном из маглорожденных, или как об одном из волшебников. он считает себя выше всех, единственным достойным управлять всем миром.
да и в послений главе намек на неприязнь скорее не к маг миру, а к его устройству.