Да уж, со стороны все выглядит очень печально, и вытравливать из него это намертво въевшееся мироощущение "вынужденного одиночки" Гермионе придется очень долго, временами посредством шоковой терапии (незапланированной, по принципу "оно само так вышло")
Думаю, да, одиночество не в последнюю очередь - в отличие от Снейпа, ее оно напрягает. Но он не всякую ее заботу и внимание будет способен оценить (во всяком случае, далеко не сразу)