"Сейфы разыскиваемых преступников просто опечатаны, но я не верю в то, что у Блэков был один-единственный сейф. Даже в каноне после своего ареста Сириус свободно мог им распоряжаться. После ухода из семьи он вполне мог арендовать личную ячейку под левым именем."

В каноне, до ГП и ДС гоблины были независимой расой, дела людей их не интесовали, так что тот же Сириус после Азкабана вполне мог прийти, чтобы снять денег со счета. Опять же, несмотря на массовые аресты УпСов в начале 1980-х, никто не перетряхнул их сейфы - опять же, гоблины могли быть против, что это нарушает устав их банка и т.д.

"Сквибизация", как выразился Джеймс - насильственное исчезновение магических способностей, то бишь как бы вымывание их из крови. Не думаю, что такое мощное изменение на генетическом уровне пройдет гладко."

Смотря какой уровень изменений. Это может быть как "химическое" выключение гена, отвечающего за магию, тогда бывшие магглорожденные породят сквибов или магглов. Могут быть и более глобальные изменения, запускающие ряд необратимых процессов в организме.

"Цель Волдеморта - распространить данный вирус по всему миру. Вирус по его расчетам должен погубить всех маглорожденных."

Так убить всех магглорожденных ("погубить") или просто лишить их магии? Потом, упоминалось, что на магглорожденных тестируют вирус сквибизации, при этом из катакомб вернулось очень мало студентов. Тех, кто не вернулся, убивает вирус (т.е. уже невозможно установить, стал маг сквибом или нет), убивают "доктора" как уже использованный материал, или ставят над ними новые опыты (хотя в таком случае нижний уровень уже должен быть заполнен подопытными, ведущими образ образ жизни растения)?

Еще заметила: такое впечатление, что с Гермионой и с Патрицией работали разные медсестры. Во всяком случае, их поведение с подопытными сильно различалось.