Логично. Собсно и в нашей истории аристократы обычно крайне нервно реагируют на создание "федеральной" регулярной армии. Ибо конец немного предсказуем - в той же Франции для успокоения умов армия однажды взяла и посносила нафиг почти все укрепленные замки. В основном, конечно, хозяев предварительно вывели, да и сносили не столько замки, сколько стены укреплений...
Хм. Даже не знаю, что аристократам в итоге опасней - гипотетический бессмертный Темный Лорд во главе всего или нормальное министерство и нормальное же обучение магии маглорожденных и полукровок. Первое было бы, по мнению многих, в общем безопасней - если бы, конечно, Волдеморт не был психом на всю голову после создания крестражей.
Скорее всего, у Вас получается почти идеальный вариант - сравнительно здравосмыслящая группировка аристократов у власти, которая перебьет экстремистов и аккуратно, контролируемо попробует нормально ассимилировать маглорожденных. Чтоб не получилось по варианту Франции - когда люди из африканских дерьмостран приезжают в нормальную страну и пытаются превратить ее в свою дерьмострану.