По моему, прямым наследником (кроме евреев) считается старший сын старшего сына и т.д. По крайней мере так определяют наследников престола. То есть прямой наследник так бы и оставался Слизерином. Разве только внебрачные дети остаются наследниками, но не носят фамилию.
А у Тома несколько поколений переходило по женской линии: Мракс, Певерелл (если он потомок Слизерина).
Но при этом он может быть ближайшим родственником по непрямой линии.