Погранцы в России пока всё-таки магглы. Убийство Каркарова, если подумать - лучший выход из ситуации. Предположим, маги отказали Каркарову в укрытии. В таком случае, велика возможность, что Игорёк осел бы где-нибудь среди магглов. Узнай Волдеморт, что Каркаров скрывается где-то в России, он бы в эти тонкости вникать не стал - явился бы прямо в Москву и устроил АдЪ и Израиль русскому магическому сообществу