чесать в затылке это:

смотреть как баран на новые ворота, хлопать глазами, ума не приложить, становиться в тупик, быть озадаченным, находиться в недоумении, теряться в догадках, пожимать плечами, чесать затылок, разводить руками, недоумевать, быть в недоумении

Словарь русских синонимов.

http://dic.academic.ru/dic.nsf/dic_synonims/267751/чесать