В Легенды Перекрёстка лезть не советую. Это сырая гадость, из которой только 1 часть норм - её в своё время выкладывал рассказом сюда. Так что по ссылке не ходить.

""концепция Бытия либо Пустоты" - что это?" - так и есть. Философская идея бытия и философская идея пустоты. Суть в том, что Творец может философские идеи... осуществлять. Или напрямую или в соединении с чем-либо.

"Прямые порталы. Как они работают? В этой вселенной и вселенной Атики(вселенная ГП(?))" - хех, я не физик-теоретик, чтобы обосновывать, так что увы.

"Инвариант временной координаты. Что это? Примерно понимаю, но все равно..." - абсолютная система координат, конечно же. В отличие от нашего мира, в Третьем Доме такая существует.

"Метаграфик. Чем отличается от обычного?" - очевидно, что метаграфик - это график графиков.