За что-то ведь его выгнали из Хогвартса. Возможно, как раз за то, что он не видит границы чужой собственности, когда речь идет о благополучии спасенных им животных. Тут сложно сказать, прав он с моральной точки зрения или нет. Потому что альтернатива его спасения и прокорма - уничтожение опасной "твари".
Чемодан совершенно не обязательно было делать, можно было его купить. Ньют очевидно не способен полностью контролировать чемодан, раз из него периодических сбегает Нюхлер. Если бы он сам сделал чемодан и был магом 100500 уровня, чемодан бы не открывался от желания мелкого воришки сбацать монетку.
Алсо Ньют - не единственный человек, помешанный на животных. В реальной жизни тоже есть такие "чудики", кормящие 50-т кошек в одной квартире или выхаживающие австралийских пингвинов с единственной зарплате. Одежда и внешний вид Ньюта сильно запущены, он не увешивает себя брильянтами, так что здесь весь упор на благополучие питомцев. Даже путешествие через океан совершил, чтобы помочь одному из них (а остальных негде было оставить, он потащил всех за собой). Возможно, если у Ньюта нет живых родителей, ради всего этого безобразия он продал дом и наследство.

З.Ы. Конспирологические теории - это неплохо, и Дамблдор вполне мог наблюдать за действиями своего студента на территории Штатов, вот только участие в происходящем самого Ньюта сомнительно. Хотя бы из-за того, что Ньют настолько клал болт на общественность, что чуть не подверг себя смертной казни. И спасла его совершенно случайная легилимент, а не лев из кустов. Причем спасла из-за его доброго отношения и собственного дружелюбия, а не ради яйца феникса. Это немножко другой уровень заговоров и подстав, чем в, скажем, "Дюне". И местами в случаях, где написано, что Ньют - беспечный мальчик, влюбленный в животных (версия Хагрид 0.1), можно этому поверить. Особенно с учетом того, что Ньют - не главный герой цикла, он просто представляет завязку, оформленную в декорациях фантастического зверинца. Это как если бы историю Гарри нам показали с детства Хагрида, который тоже встретил Риддла в похожем возрасте (как Ньют встретил Гриндевальда), но дальше их пути разошлись, и участие в войне Хагрида не такое грандиозное, как у Гарри или самого Дамблдора.