Я напоминаю, что Император всё-таки приказал только арестовать Магнуса и Легион, просто Хорус, успешно используя антипатии Русса и прочие антимагические настроения, сумел подбить их на то, что получилось.
Что же до Никеи и всяких антимагических настроений, надо помнить, что "помог" Тзинч и агентура Лоргара, которая сорок лет нежно и бережно готовила почву для всего этого. По сути, не было никаких шансов, что Магнус сможет что-то там изменить на Никейском Совете.
Впрочем, внимательный анализ того ***дского цирка, коим является Никейский Совет, дает понять, что это была сплошная подстава и со стороны Императора, да. Не глупая, но подстава.

Магнуса, в общем, жалко. Просто собрал все грабли, которые перед ним Тзинч положил, увы.