>есть конфундус

Для очень немногих заклинаний нам известны даты изобретения. Конфундус не из их числа.

>Т.е. для своего времени, с поправкой на общее развитие общества, маги все равно должны быть сильнее магов?

Ну, их меньше. В прямой конфронтации — нет. Да я думаю, волшебники долгое время и не мыслили себя, как отдельное общество.

>Т.е. , по вашему, таки маги прячутся от маглов, потому что те могут их уничтожить?

Скорее использовать против воли. Ну, и политические какие-то причины наверняка были, и Охота на ведьм всё же была заметна, особенно если принимать во внимание численность магов. И вообще осознание себя, в какой-то мере.