старая перечница
Там есть такой нюанс, который, возможно, и не был задуман автором, но прекрасно ложится на характер персонажа. И изнасилование вполне могло быть "изнасилованием".

ГГ нужно восстановить клан. Девка - куноичи (в Наруто шиноби - это солдаты-наёмники, а не известные нам ниндзя, скорее "боевые маги"). Она на экзаменах проявила себя жестокой, прошаренной и очень циничной сукой (опять-таки, в каноне), не без ноток садизма. Вследствие иностранного вторжения она попала в плен и ГГ её безо всяких побоев принудил к сексу, в расчёте на "получить потомство".

Девка очень сильна - там вообще личное могущество у персонажей дайбожэ.

Итак, что выходит в результате действий гг? Практически дипломатический скандал, где куноичи возвращается домой вместе с возможным ребёнком. Бедненькая мать-одиночка, скажешь ты?
Но там есть маааахонький нюанс. Клан ГГ обладает генетической особенностью - волшебными глазами, являющимися в том мире практически главным читом. И за подобные глаза (из другого клана, с другим набором свойств, по моему мнению сиииииильно слабее), другое Гакурезато (наёмничьи города-государства) где-то с десяток лет назад едва не устроило глобальную войну.
Ещё один нюанс: девка при первой встрече с ГГ на него очень-очень сильно запала. То есть пацанчик - не горбатый старик с вооот таким пузом, а местный аналог Брэда Питта в лучшие годы.

Сухой остаток "не сопротивления", и сдачи в плен.
1. Осталась жива. Остались живы её братья.
2. Секс с чуваком, который ей очень-очень нравится. Причём, без "сунул-высунул, вытер хер об занавеску" - ГГ приложил усилия, чтобы удовольствие партнёру доставить, а сноровки и умений ему хватает - в нашем мире он был эдаким Казановой (что его и привело, кстати, к кончине).
3. Ребёнок с волшебными глазами, который становится сокровищем её гакурезато.

Девка - дочь лидера этого гакурезато, впоследствии ставшая одним из помощников и советников. Очень-очень умная (на этом в каноне сделан неоднократно акцент). Последствия для действий ГГ (который успел неоднократно пожалеть, что думал хером, когда о них узнал) она не может не осознавать на все 100%.

Итак, внимание, вопрос. Почему она не сопротивлялась?

У меня возник чуток другой вопрос: "Какая у неё должна быть выдержка, чтобы суметь сдержать злорадный смех".

И в дополнение, картинка. Канонная встреча ГГ и "изнасилованной".
https://vignette.wikia.nocookie.net/narutocouple/images/f/f3/74307324032747324.PNG