Один только раз я читала более-менее хотя бы попытку обоснуя, как же оно так вышло, что стрясся омегаверс. И то, в подробностях не очень заморачивались, накидали немножко условий - общо так.
Типа боги наказали таким образом население. За что наказали - не очень поняла, вроде как за плохое отношение к женщинам. Наказали же тем, что женщины перестали рождаться.
Немного (изрядно) подпорчено было ещё и убийственным сочетанием попаданства наших погибших девиц в тела омег того мира, космическими кораблями и храмами, в которых молились женщинам-божествам, умоляя их вернуть женщин. Всё в одном флаконе.

Обычно же просто попадались омегаверсы по принципу "так автор хочет, идите".
Возможно, я просто устала от такого раньше, чем набрела на что-то реально интересное.