Я держу на компе файлы. После публикации очередной главы копирую в файл отбеченный вариант. И всегда синхронизую фикбуковскую версию со здешней (здешнюю считаю основной). Таким образом, у меня есть два бэкапа - на диске и на втором интернет-ресурсе.
Осталось гуглодоки освоить - это, судя по всему, вообще полезная штука для самых разных целей. Так лень же :(