Какой-то очень наивный и тупой план получается у Данзо в таком случае. Особенно эта часть:
>> Итачи проредил бы самых сильных шиноби, восстание бы захлебнулось.

Откуда при таких раскладах Данзо мог быть уверен, что Итачи проредит достаточно сильных шиноби и именно нужных сильных шиноби? А не кучу слабаков и именно тех из сильных, кто был против восстания? Ну, совпало бы так?

При таких раскладах гораздо логичнее было приказать убрать именно сторонников восстания, а не вырезать всех подряд в надежде, что умрут именно нужные шиноби.

Но я думаю, что всё проще. Данзо загендзючил Итачи глазом Шисуи, у Итачи на почве психической напряжённости, моральной дилеммы и конфликта навязанных установок поехала крыша, и он порешил вообще всех, не оставив даже мальков на развод Данзо.