Это исходя из того, что сначала Философский камень надо у Фламеля выпросить. Он 600 лет этот камень хранил, в том числе - и когда пылали костры Инквизиции, и когда в Столетней войне, Религиозных войнах и прочих кофликтах по всей Франции бегали отряды наемников в том числе и в соображениях "где что плохо лежит?", и во времена войны с Гриндевальдом Фламель как-то не обеспокоился. А тут камень "совершенно случайно" оказывается как раз там, где ему реально грозит опасность...
Я уж совсем молчу о том, что Камень, которому опасно находится в подземельях Гринготтса - таскает по всему Косому полувеликан с хроническим недержанием речи, которому, к тому же запрещено колдовать...

Гермиону он приглашал как подругу Избранного, а Малфоя не пригласил, чтобы с этим самым Избранным не поссориться.
Опять-таки, не знаю, как в тексте, а в фильме Том при этом разговоре поигрывает кольцом Гонтов. Т.е. он уже не тот паникующий ребенок, который не догадался даже труп Плаксы в Тайную комнату закинуть, и рассказать, что "от кого-то слышал, что обижаемая соучениками девчонка собиралась свалить в Запретный лес".