WMR
наверное, потому что дата последнего увиденного коммента меньше даты, запомненной в счетчике (или количество комментов в топике меньше того, из-за которого сработал счетчик - без понятия на что именно счетчик настроен), поэтому метка не снимается автоматом. Надо нажать на "пометить все комменты прочтенными" - это сбрасывает счетчик принудительно.