Кивнула своей головой в знак согласия, выражая согласие с услышанным.
В англоязычных фиках такое постоянно "nod his head", но здесь-то зачем? Ах да, автор же не профессионал, хотя вообще странно. Чтобы разбирать его фанфики, надо иметь право (и обязательство) и быть профессионалом, а чтобы писать, автору не обязательно быть профессионалом?