Выбирайте, где коллектив приятней и науч.рук адекватнее, потому что от него многое зависит. В целом, лучше там, где люди моложе, больше современного оборудования, где пишут на английском и получают гранты - это может быть лаба как в гос.университете, так и при ран, нужно смотреть, где сидит конкретный коллектив. Если приходите и видите советский антураж, где мудрые старцы полдня гоняют чаи и ещё полдня травят байки о своём научном величии - там может быть душевно, но научный прогресс там замер.

Аспирантура - это фактически рабство на несколько лет, вас могут запрячь преподавать вместо какого-нибудь хмыря, вы можете писать статьи за весь коллектив и вынужденно ставить их в соавторы. Перед защитой научник может "закапризничать" - пропасть с радара, сказать, что вы ещё не готовы, попросить переписать весь кирпич, сказать самой искать оппонентов и т.п.. Поэтому понимая, как многое от него зависит, лучше сразу выбрать _адекватного_ человека.