По моему опыту, лучше заранее о таком договариваться. Готовую работу под своё крыло может взять профессор, который набирает нужное число защитившихся под свою докторскую. Вопрос ещё в конфликте интересов: если использовать в кандидатской результаты, полученные во время работы в качестве мнс, то правильно, наверное, брать коллег в консультанты.
Лучше до того, как готовить работу, договориться с научным руководителем, потому что одни и те же результаты можно подогнать под разные специальности. Научник чётко скажет: подаёмся в такой-то совет, специальность такая-то, оппоненты будут вон те мужики, нужно прочитать их работы - с учётом всех этих факторов уже пилится кирпич.

Нет уж- нет уж) мы от любой секретности бежали, как от огня) слишком просто стать невыездным (а в чём тогда фан, если не в научном туризме?) / получить заказ, от которого нельзя отказаться...